Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP8P40818 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP8P40818 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP8P40818 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP8P40818 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP8P40818 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP8P40818 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP8P40818 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP8P40818 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP8P40818 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP8P40818 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP8P40818 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP8P40818 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP8P40818 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP8P40818 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP8P40818 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP8P40818 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP8P40818 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP8P40818 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP8P40818 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP8P40818 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP8P40818 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP8P40818 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP8P40818 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP8P40818 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP8P40818 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP8P40818 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP8P40818 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP8P40818 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP8P40818 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP8P40818 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP8P40818 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP8P40818 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP8P40818 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP8P40818 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP8P40818 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP8P40818 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP8P40818 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP8P40818 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP8P40818 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP8P40818 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP8P40818 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP8P40818 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP8P40818 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP8P40818 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP8P40818 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP8P40818 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP8P40818 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP8P40818 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP8P40818 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP8P40818 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP8P40818 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP8P40818 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP8P40818 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP8P40818 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP8P40818 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP8P40818 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP8P40818 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP8P40818 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP8P40818 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP8P40818 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP8P40818 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP8P40818 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP8P40818 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP8P40818 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP8P40818 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP8P40818 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP8P40818 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP8P40818 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP8P40818 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP8P40818 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP8P40818 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP8P40818 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP8P40818 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP8P40818 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP8P40818 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP8P40818 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP8P40818 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP8P40818 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP8P40818 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP8P40818 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP8P40818 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP8P40818 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP8P40818 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP8P40818 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP8P40818 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP8P40818 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP8P40818 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP8P40818 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP8P40818 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP8P40818 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP8P40818 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP8P40818 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP8P40818 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP8P40818 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP8P40818 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP8P40818 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP8P40818 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP8P40818 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP8P40818 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms