Protein–RNA interactions for Protein: P40462

TMA108, Protein TMA108, yeast

Predictions only

Length 946 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TMA108	P40462	YCL012C	YCL012C	405 nt		5.01	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	CDC6	YJL194W	1542 nt		5.01	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	KEX1	YGL203C	2190 nt		5.01	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	YND1	YER005W	1893 nt		5	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	COT1	YOR316C	1320 nt		5	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	ABD1	YBR236C	1311 nt		5	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	BUD8	YLR353W	1812 nt		5	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	IOC4	YMR044W	1428 nt		5	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	NSE3	YDR288W	912 nt		5	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	YER084W	YER084W	387 nt		5	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	JAC1	YGL018C	555 nt		5	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	JLP1	YLL057C	1239 nt		5	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	PPG1	YNR032W	1107 nt		5	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	BUB3	YOR026W	1026 nt		5	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	COX11	YPL132W	903 nt		5	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	GPB1	YOR371C	2694 nt		5	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	MMT1	YMR177W	1533 nt		5	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	YAP1802	YGR241C	1707 nt		5	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	UTP6	YDR449C	1323 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	ORC6	YHR118C	1308 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	DOA1	YKL213C	2148 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	SBE2	YDR351W	2595 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	BUD30	YDL151C	582 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	YEL067C	YEL067C	588 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	VPS29	YHR012W	849 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	CDC28	YBR160W	897 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	PRO2	YOR323C	1371 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	ABF1	YKL112W	2196 nt		4.99	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	SWC3	YAL011W	1878 nt		4.98	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	PAL1	YDR348C	1500 nt		4.98	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	GRS1	YBR121C	2004 nt		4.98	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	SAE3	YHR079C-A	276 nt		4.98	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	REX3	YLR107W	1215 nt		4.98	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	ECM15	YBL001C	315 nt		4.98	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	IMD3	YLR432W	1572 nt		4.98	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	MCM2	YBL023C	2607 nt		4.98	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	RAD7	YJR052W	1698 nt		4.98	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	ARX1	YDR101C	1782 nt		4.98	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	BUD7	YOR299W	2241 nt		4.97	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	TGL4	YKR089C	2733 nt		4.97	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	SIP5	YMR140W	1470 nt		4.97	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	MRP13	YGR084C	1020 nt		4.97	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	TTI2	YJR136C	1266 nt		4.97	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	APS1	YLR170C	471 nt		4.97	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	YNL296W	YNL296W	315 nt		4.97	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	DBF4	YDR052C	2115 nt		4.97	□□□□□ -1.61
TMA108	P40462	OCA5	YHL029C	2040 nt		4.96	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	TYR1	YBR166C	1359 nt		4.96	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	AUA1	YFL010W-A	285 nt		4.96	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	YFR045W	YFR045W	930 nt		4.96	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	YGR153W	YGR153W	654 nt		4.96	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	MIM2	YLR099W-A	264 nt		4.96	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	ORM2	YLR350W	651 nt		4.96	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	HFA1	YMR207C	6372 nt		4.96	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	YPL199C	YPL199C	723 nt		4.96	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	ASK10	YGR097W	3441 nt		4.95	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	SCL1	YGL011C	759 nt		4.95	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	PDR10	YOR328W	4695 nt		4.95	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	OAF1	YAL051W	3144 nt		4.94	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	SYP1	YCR030C	2613 nt		4.94	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	RRP3	YHR065C	1506 nt		4.94	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	YEL053W-A	YEL053W-A	348 nt		4.94	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	KTR2	YKR061W	1278 nt		4.94	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	RPS1B	YML063W	768 nt		4.94	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	ERD2	YBL040C	660 nt		4.94	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	YNR042W	YNR042W	429 nt		4.94	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	POS5	YPL188W	1245 nt		4.94	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	snR17b	snR17b	332 nt		4.94	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	SHE3	YBR130C	1278 nt		4.94	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	TPO2	YGR138C	1845 nt		4.94	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	YDL124W	YDL124W	939 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	YDL241W	YDL241W	372 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	YKL023W	YKL023W	834 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	YLR049C	YLR049C	1287 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	ATG8	YBL078C	354 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	YBR016W	YBR016W	387 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	SPS4	YOR313C	1017 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	RCM1	YNL022C	1473 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	CDC9	YDL164C	2268 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	HRK1	YOR267C	2280 nt		4.93	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	MIH1	YMR036C	1665 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	RKM3	YBR030W	1659 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	ARO9	YHR137W	1542 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	KAR2	YJL034W	2049 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	PUF2	YPR042C	3228 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	YHP1	YDR451C	1062 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	HSP31	YDR533C	714 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	tX(XXX)D	tX(XXX)D	100 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	MDY2	YOL111C	639 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	MGR2	YPL098C	342 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	MET16	YPR167C	786 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	YPR169W-A	YPR169W-A	219 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	YPR170W-B	YPR170W-B	258 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	EMP46	YLR080W	1335 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	SFI1	YLL003W	2841 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	LHP1	YDL051W	828 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	IRC6	YFR043C	714 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	NPY1	YGL067W	1155 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	YMR105W-A	YMR105W-A	195 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TMA108	P40462	MAK3	YPR051W	531 nt		4.91	□□□□□ -1.62

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