Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 YBR139WYBR139W 1527 nt4.06□□□□□ -1.76
AVT5P38176 MDM10YAL010C 1482 nt4.06□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YDR444WYDR444W 2064 nt4.06□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.06□□□□□ -1.76
AVT5P38176 THP1YOL072W 1368 nt4.06□□□□□ -1.76
AVT5P38176 NOB1YOR056C 1380 nt4.06□□□□□ -1.76
AVT5P38176 SHR3YDL212W 633 nt4.06□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YDR124WYDR124W 975 nt4.06□□□□□ -1.76
AVT5P38176 IRC6YFR043C 714 nt4.06□□□□□ -1.76
AVT5P38176 SEC28YIL076W 891 nt4.06□□□□□ -1.76
AVT5P38176 RPF2YKR081C 1035 nt4.06□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YML090WYML090W 387 nt4.06□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YMR082CYMR082C 357 nt4.06□□□□□ -1.76
AVT5P38176 SCW10YMR305C 1170 nt4.06□□□□□ -1.76
AVT5P38176 SSU72YNL222W 621 nt4.06□□□□□ -1.76
AVT5P38176 OSW1YOR255W 837 nt4.06□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YPL077CYPL077C 723 nt4.06□□□□□ -1.76
AVT5P38176 RFT1YBL020W 1725 nt4.06□□□□□ -1.76
AVT5P38176 FUI1YBL042C 1920 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 PHO84YML123C 1764 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 ENT5YDR153C 1236 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 SLO1YER180C-A 258 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 CAF16YFL028C 870 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 COS4YFL062W 1140 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 TIM21YGR033C 720 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YNG2YHR090C 849 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 DCG1YIR030C 735 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YKL151CYKL151C 1014 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 SEC65YML105C 822 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 COS3YML132W 1140 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YMR085WYMR085W 1299 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 AAH1YNL141W 1044 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 RPN8YOR261C 1017 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 EFM2YBR271W 1260 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 COS2YBR302C 1140 nt4.05□□□□□ -1.76
AVT5P38176 ADY2YCR010C 852 nt4.04□□□□□ -1.76
AVT5P38176 CNL1YDR357C 369 nt4.04□□□□□ -1.76
AVT5P38176 CIA2YHR122W 696 nt4.04□□□□□ -1.76
AVT5P38176 LNP1YHR192W 837 nt4.04□□□□□ -1.76
AVT5P38176 AIM23YJL131C 1071 nt4.04□□□□□ -1.76
AVT5P38176 DAN1YJR150C 897 nt4.04□□□□□ -1.76
AVT5P38176 MRT4YKL009W 711 nt4.04□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YLR366WYLR366W 306 nt4.04□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YLR374CYLR374C 390 nt4.04□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt4.04□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YIM2YMR151W 438 nt4.04□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YMR315WYMR315W 1050 nt4.04□□□□□ -1.76
AVT5P38176 ARG1YOL058W 1263 nt4.04□□□□□ -1.76
AVT5P38176 PRM4YPL156C 855 nt4.04□□□□□ -1.76
AVT5P38176 SUT2YPR009W 807 nt4.04□□□□□ -1.76
AVT5P38176 NAT3YPR131C 588 nt4.04□□□□□ -1.76
AVT5P38176 PTM1YKL039W 1572 nt4.04□□□□□ -1.76
AVT5P38176 ADE3YGR204W 2841 nt4.04□□□□□ -1.76
AVT5P38176 RRI1YDL216C 1323 nt4.03□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YHR054CYHR054C 1065 nt4.03□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YIL152WYIL152W 708 nt4.03□□□□□ -1.76
AVT5P38176 SUI2YJR007W 915 nt4.03□□□□□ -1.76
AVT5P38176 ELF1YKL160W 438 nt4.03□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YKR047WYKR047W 306 nt4.03□□□□□ -1.76
AVT5P38176 YBL036CYBL036C 774 nt4.03□□□□□ -1.76
AVT5P38176 ARC40YBR234C 1155 nt4.03□□□□□ -1.76
AVT5P38176 TSL1YML100W 3297 nt4.03□□□□□ -1.76
AVT5P38176 GAS5YOL030W 1455 nt4.03□□□□□ -1.76
AVT5P38176 ERG4YGL012W 1422 nt4.03□□□□□ -1.76
AVT5P38176 GSM1YJL103C 1857 nt4.03□□□□□ -1.77
AVT5P38176 VID28YIL017C 2766 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 ZRC1YMR243C 1329 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 PRM2YIL037C 1971 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 NUP2YLR335W 2163 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 PIM1YBL022C 3402 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 RHB1YCR027C 630 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 YDL124WYDL124W 939 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 CYM1YDR430C 2970 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 YER085CYER085C 522 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 SEH1YGL100W 1050 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 AIR1YIL079C 1083 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 YJL218WYJL218W 591 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 FUN19YAL034C 1242 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 UBI4YLL039C 1146 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 YLR194CYLR194C 765 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 IMP2YMR035W 534 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 YNL226WYNL226W 411 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 TRS33YOR115C 807 nt4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 484.8 ms