Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTN2P35609 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms