Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD13P35453 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD13P35453 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms