Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LSP1P33241 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSP1P33241 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSP1P33241 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSP1P33241 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSP1P33241 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSP1P33241 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSP1P33241 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSP1P33241 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSP1P33241 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSP1P33241 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSP1P33241 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSP1P33241 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSP1P33241 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSP1P33241 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSP1P33241 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSP1P33241 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSP1P33241 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSP1P33241 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSP1P33241 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSP1P33241 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSP1P33241 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSP1P33241 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSP1P33241 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSP1P33241 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSP1P33241 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSP1P33241 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LSP1P33241 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LSP1P33241 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSP1P33241 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSP1P33241 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSP1P33241 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSP1P33241 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSP1P33241 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSP1P33241 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSP1P33241 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSP1P33241 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSP1P33241 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSP1P33241 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSP1P33241 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSP1P33241 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSP1P33241 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSP1P33241 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSP1P33241 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSP1P33241 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSP1P33241 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LSP1P33241 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSP1P33241 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSP1P33241 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSP1P33241 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSP1P33241 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSP1P33241 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSP1P33241 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSP1P33241 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSP1P33241 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LSP1P33241 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSP1P33241 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSP1P33241 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSP1P33241 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSP1P33241 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSP1P33241 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSP1P33241 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSP1P33241 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSP1P33241 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSP1P33241 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSP1P33241 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LSP1P33241 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSP1P33241 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSP1P33241 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSP1P33241 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSP1P33241 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSP1P33241 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSP1P33241 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSP1P33241 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSP1P33241 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSP1P33241 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSP1P33241 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSP1P33241 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSP1P33241 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSP1P33241 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSP1P33241 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSP1P33241 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSP1P33241 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSP1P33241 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LSP1P33241 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSP1P33241 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSP1P33241 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSP1P33241 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSP1P33241 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSP1P33241 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSP1P33241 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSP1P33241 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSP1P33241 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSP1P33241 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSP1P33241 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSP1P33241 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSP1P33241 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSP1P33241 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSP1P33241 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSP1P33241 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms