Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCKARP32238 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCKARP32238 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCKARP32238 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCKARP32238 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCKARP32238 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCKARP32238 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCKARP32238 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCKARP32238 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCKARP32238 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCKARP32238 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCKARP32238 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCKARP32238 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCKARP32238 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCKARP32238 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCKARP32238 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCKARP32238 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCKARP32238 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCKARP32238 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCKARP32238 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCKARP32238 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCKARP32238 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCKARP32238 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCKARP32238 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCKARP32238 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCKARP32238 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCKARP32238 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCKARP32238 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCKARP32238 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCKARP32238 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCKARP32238 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCKARP32238 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCKARP32238 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCKARP32238 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCKARP32238 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCKARP32238 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCKARP32238 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCKARP32238 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCKARP32238 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCKARP32238 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCKARP32238 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCKARP32238 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCKARP32238 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCKARP32238 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCKARP32238 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCKARP32238 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCKARP32238 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCKARP32238 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCKARP32238 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCKARP32238 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCKARP32238 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCKARP32238 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCKARP32238 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCKARP32238 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCKARP32238 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCKARP32238 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCKARP32238 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCKARP32238 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCKARP32238 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCKARP32238 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCKARP32238 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCKARP32238 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCKARP32238 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCKARP32238 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCKARP32238 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCKARP32238 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCKARP32238 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCKARP32238 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCKARP32238 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCKARP32238 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCKARP32238 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCKARP32238 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCKARP32238 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCKARP32238 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCKARP32238 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCKARP32238 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCKARP32238 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCKARP32238 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCKARP32238 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCKARP32238 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCKARP32238 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCKARP32238 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCKARP32238 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCKARP32238 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCKARP32238 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCKARP32238 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCKARP32238 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCKARP32238 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKARP32238 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKARP32238 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKARP32238 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKARP32238 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKARP32238 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKARP32238 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKARP32238 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKARP32238 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKARP32238 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKARP32238 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCKARP32238 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKARP32238 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms