Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRIP30626 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRIP30626 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRIP30626 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRIP30626 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRIP30626 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRIP30626 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRIP30626 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRIP30626 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRIP30626 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRIP30626 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRIP30626 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRIP30626 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRIP30626 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SRIP30626 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRIP30626 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SRIP30626 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRIP30626 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRIP30626 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRIP30626 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRIP30626 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRIP30626 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRIP30626 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRIP30626 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRIP30626 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRIP30626 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRIP30626 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRIP30626 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRIP30626 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRIP30626 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRIP30626 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRIP30626 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRIP30626 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRIP30626 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRIP30626 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRIP30626 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRIP30626 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRIP30626 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SRIP30626 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRIP30626 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRIP30626 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRIP30626 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRIP30626 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRIP30626 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRIP30626 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRIP30626 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRIP30626 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRIP30626 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRIP30626 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRIP30626 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRIP30626 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SRIP30626 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SRIP30626 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SRIP30626 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRIP30626 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRIP30626 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRIP30626 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRIP30626 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRIP30626 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRIP30626 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRIP30626 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRIP30626 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRIP30626 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRIP30626 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRIP30626 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRIP30626 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRIP30626 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRIP30626 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRIP30626 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRIP30626 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRIP30626 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRIP30626 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRIP30626 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRIP30626 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRIP30626 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRIP30626 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SRIP30626 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SRIP30626 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRIP30626 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRIP30626 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRIP30626 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRIP30626 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRIP30626 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRIP30626 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRIP30626 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRIP30626 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRIP30626 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRIP30626 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRIP30626 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRIP30626 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRIP30626 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRIP30626 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRIP30626 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRIP30626 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRIP30626 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRIP30626 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRIP30626 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRIP30626 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRIP30626 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRIP30626 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms