Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKCHP24723 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCHP24723 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms