Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND1P24385 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND1P24385 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND1P24385 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND1P24385 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND1P24385 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND1P24385 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND1P24385 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND1P24385 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND1P24385 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND1P24385 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND1P24385 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCND1P24385 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCND1P24385 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCND1P24385 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCND1P24385 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCND1P24385 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCND1P24385 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCND1P24385 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCND1P24385 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCND1P24385 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCND1P24385 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCND1P24385 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCND1P24385 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND1P24385 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND1P24385 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND1P24385 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND1P24385 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND1P24385 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND1P24385 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND1P24385 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND1P24385 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND1P24385 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND1P24385 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCND1P24385 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND1P24385 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND1P24385 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND1P24385 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND1P24385 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND1P24385 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND1P24385 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND1P24385 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND1P24385 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND1P24385 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND1P24385 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCND1P24385 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND1P24385 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND1P24385 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND1P24385 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND1P24385 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND1P24385 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND1P24385 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND1P24385 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND1P24385 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND1P24385 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCND1P24385 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND1P24385 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND1P24385 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND1P24385 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND1P24385 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND1P24385 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND1P24385 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND1P24385 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND1P24385 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND1P24385 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND1P24385 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND1P24385 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCND1P24385 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND1P24385 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND1P24385 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND1P24385 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND1P24385 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND1P24385 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND1P24385 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND1P24385 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND1P24385 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCND1P24385 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND1P24385 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND1P24385 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND1P24385 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND1P24385 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND1P24385 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND1P24385 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND1P24385 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND1P24385 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCND1P24385 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCND1P24385 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCND1P24385 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCND1P24385 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCND1P24385 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND1P24385 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND1P24385 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND1P24385 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND1P24385 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND1P24385 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND1P24385 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND1P24385 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND1P24385 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND1P24385 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND1P24385 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms