Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRDP23468 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRDP23468 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
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