Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PVALBP20472 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PVALBP20472 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PVALBP20472 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PVALBP20472 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PVALBP20472 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PVALBP20472 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PVALBP20472 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PVALBP20472 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PVALBP20472 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PVALBP20472 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PVALBP20472 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PVALBP20472 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PVALBP20472 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PVALBP20472 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PVALBP20472 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PVALBP20472 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PVALBP20472 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PVALBP20472 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PVALBP20472 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PVALBP20472 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PVALBP20472 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PVALBP20472 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PVALBP20472 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PVALBP20472 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PVALBP20472 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PVALBP20472 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PVALBP20472 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PVALBP20472 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PVALBP20472 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PVALBP20472 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PVALBP20472 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PVALBP20472 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PVALBP20472 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PVALBP20472 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PVALBP20472 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PVALBP20472 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PVALBP20472 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PVALBP20472 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PVALBP20472 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PVALBP20472 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PVALBP20472 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PVALBP20472 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PVALBP20472 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PVALBP20472 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PVALBP20472 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PVALBP20472 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PVALBP20472 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PVALBP20472 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PVALBP20472 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PVALBP20472 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PVALBP20472 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PVALBP20472 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PVALBP20472 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PVALBP20472 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PVALBP20472 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PVALBP20472 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PVALBP20472 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PVALBP20472 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PVALBP20472 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PVALBP20472 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PVALBP20472 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PVALBP20472 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PVALBP20472 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PVALBP20472 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PVALBP20472 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PVALBP20472 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PVALBP20472 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PVALBP20472 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PVALBP20472 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PVALBP20472 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PVALBP20472 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PVALBP20472 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PVALBP20472 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PVALBP20472 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PVALBP20472 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms