Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCNA2P20248 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNA2P20248 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms