Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFEBP19484 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFEBP19484 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFEBP19484 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFEBP19484 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFEBP19484 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFEBP19484 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFEBP19484 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TFEBP19484 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFEBP19484 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFEBP19484 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFEBP19484 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFEBP19484 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFEBP19484 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TFEBP19484 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TFEBP19484 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TFEBP19484 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFEBP19484 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFEBP19484 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFEBP19484 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFEBP19484 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFEBP19484 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFEBP19484 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFEBP19484 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFEBP19484 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFEBP19484 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFEBP19484 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFEBP19484 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFEBP19484 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TFEBP19484 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFEBP19484 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFEBP19484 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFEBP19484 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFEBP19484 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFEBP19484 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFEBP19484 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFEBP19484 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFEBP19484 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFEBP19484 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFEBP19484 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFEBP19484 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFEBP19484 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TFEBP19484 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFEBP19484 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFEBP19484 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFEBP19484 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFEBP19484 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFEBP19484 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFEBP19484 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFEBP19484 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFEBP19484 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFEBP19484 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFEBP19484 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFEBP19484 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFEBP19484 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFEBP19484 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFEBP19484 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFEBP19484 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFEBP19484 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFEBP19484 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFEBP19484 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFEBP19484 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFEBP19484 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFEBP19484 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFEBP19484 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFEBP19484 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TFEBP19484 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFEBP19484 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFEBP19484 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFEBP19484 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFEBP19484 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFEBP19484 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFEBP19484 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFEBP19484 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFEBP19484 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFEBP19484 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFEBP19484 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFEBP19484 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFEBP19484 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFEBP19484 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TFEBP19484 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFEBP19484 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFEBP19484 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFEBP19484 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFEBP19484 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFEBP19484 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFEBP19484 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFEBP19484 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFEBP19484 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFEBP19484 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFEBP19484 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFEBP19484 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFEBP19484 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFEBP19484 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFEBP19484 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFEBP19484 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFEBP19484 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TFEBP19484 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFEBP19484 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFEBP19484 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms