Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2CP19387 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms