Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT4P19013 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT4P19013 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT4P19013 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT4P19013 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT4P19013 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT4P19013 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT4P19013 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT4P19013 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT4P19013 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT4P19013 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT4P19013 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT4P19013 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT4P19013 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT4P19013 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT4P19013 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT4P19013 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT4P19013 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT4P19013 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT4P19013 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT4P19013 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT4P19013 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT4P19013 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT4P19013 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT4P19013 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT4P19013 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT4P19013 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT4P19013 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT4P19013 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT4P19013 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT4P19013 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT4P19013 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT4P19013 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT4P19013 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT4P19013 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT4P19013 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT4P19013 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT4P19013 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT4P19013 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT4P19013 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT4P19013 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT4P19013 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT4P19013 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT4P19013 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT4P19013 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT4P19013 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT4P19013 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT4P19013 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT4P19013 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT4P19013 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT4P19013 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT4P19013 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT4P19013 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT4P19013 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT4P19013 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT4P19013 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT4P19013 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT4P19013 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT4P19013 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT4P19013 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT4P19013 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT4P19013 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT4P19013 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT4P19013 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT4P19013 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT4P19013 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT4P19013 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT4P19013 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT4P19013 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT4P19013 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT4P19013 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT4P19013 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT4P19013 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT4P19013 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT4P19013 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT4P19013 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT4P19013 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT4P19013 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT4P19013 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT4P19013 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT4P19013 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT4P19013 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT4P19013 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT4P19013 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT4P19013 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT4P19013 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT4P19013 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT4P19013 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT4P19013 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT4P19013 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT4P19013 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT4P19013 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT4P19013 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT4P19013 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT4P19013 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT4P19013 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT4P19013 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT4P19013 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT4P19013 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT4P19013 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1483.5 ms