Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RHCEP18577 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RHCEP18577 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RHCEP18577 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RHCEP18577 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RHCEP18577 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RHCEP18577 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RHCEP18577 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RHCEP18577 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RHCEP18577 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RHCEP18577 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RHCEP18577 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHCEP18577 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHCEP18577 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHCEP18577 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHCEP18577 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RHCEP18577 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHCEP18577 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHCEP18577 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHCEP18577 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RHCEP18577 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHCEP18577 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHCEP18577 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHCEP18577 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHCEP18577 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHCEP18577 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RHCEP18577 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHCEP18577 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHCEP18577 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHCEP18577 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHCEP18577 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHCEP18577 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHCEP18577 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHCEP18577 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHCEP18577 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RHCEP18577 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RHCEP18577 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHCEP18577 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHCEP18577 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHCEP18577 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHCEP18577 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RHCEP18577 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHCEP18577 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHCEP18577 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHCEP18577 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHCEP18577 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHCEP18577 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHCEP18577 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RHCEP18577 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHCEP18577 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHCEP18577 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHCEP18577 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHCEP18577 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHCEP18577 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHCEP18577 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHCEP18577 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHCEP18577 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHCEP18577 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHCEP18577 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RHCEP18577 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHCEP18577 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHCEP18577 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHCEP18577 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHCEP18577 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RHCEP18577 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHCEP18577 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHCEP18577 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHCEP18577 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHCEP18577 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHCEP18577 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHCEP18577 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHCEP18577 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHCEP18577 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHCEP18577 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHCEP18577 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHCEP18577 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHCEP18577 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RHCEP18577 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHCEP18577 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHCEP18577 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHCEP18577 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHCEP18577 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHCEP18577 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHCEP18577 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHCEP18577 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHCEP18577 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHCEP18577 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHCEP18577 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RHCEP18577 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHCEP18577 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHCEP18577 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHCEP18577 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHCEP18577 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHCEP18577 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHCEP18577 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHCEP18577 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHCEP18577 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHCEP18577 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHCEP18577 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHCEP18577 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms