Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms