Protein–RNA interactions for Protein: P17706

PTPN2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN2P17706 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN2P17706 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN2P17706 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN2P17706 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN2P17706 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN2P17706 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN2P17706 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN2P17706 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN2P17706 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN2P17706 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN2P17706 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN2P17706 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN2P17706 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN2P17706 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN2P17706 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN2P17706 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN2P17706 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN2P17706 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms