Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL7RP16871 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL7RP16871 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL7RP16871 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL7RP16871 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL7RP16871 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL7RP16871 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL7RP16871 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL7RP16871 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL7RP16871 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL7RP16871 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL7RP16871 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
IL7RP16871 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL7RP16871 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL7RP16871 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL7RP16871 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL7RP16871 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL7RP16871 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL7RP16871 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
IL7RP16871 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL7RP16871 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL7RP16871 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
IL7RP16871 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL7RP16871 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL7RP16871 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL7RP16871 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL7RP16871 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL7RP16871 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL7RP16871 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL7RP16871 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL7RP16871 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL7RP16871 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL7RP16871 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL7RP16871 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
IL7RP16871 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL7RP16871 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL7RP16871 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL7RP16871 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL7RP16871 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
IL7RP16871 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL7RP16871 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL7RP16871 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL7RP16871 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL7RP16871 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL7RP16871 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL7RP16871 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL7RP16871 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL7RP16871 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL7RP16871 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL7RP16871 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL7RP16871 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL7RP16871 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL7RP16871 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL7RP16871 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL7RP16871 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IL7RP16871 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL7RP16871 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL7RP16871 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
IL7RP16871 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL7RP16871 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL7RP16871 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL7RP16871 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL7RP16871 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL7RP16871 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL7RP16871 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL7RP16871 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL7RP16871 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
IL7RP16871 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
IL7RP16871 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
IL7RP16871 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
IL7RP16871 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL7RP16871 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL7RP16871 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL7RP16871 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL7RP16871 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL7RP16871 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL7RP16871 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL7RP16871 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL7RP16871 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL7RP16871 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL7RP16871 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL7RP16871 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL7RP16871 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL7RP16871 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL7RP16871 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL7RP16871 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL7RP16871 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL7RP16871 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL7RP16871 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL7RP16871 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IL7RP16871 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IL7RP16871 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IL7RP16871 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IL7RP16871 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IL7RP16871 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IL7RP16871 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IL7RP16871 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
IL7RP16871 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IL7RP16871 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IL7RP16871 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms