Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXB3P14651 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB3P14651 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms