Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTN1P12814 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN1P12814 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms