Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT3P12035 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT3P12035 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT3P12035 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT3P12035 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT3P12035 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT3P12035 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT3P12035 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT3P12035 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT3P12035 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT3P12035 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT3P12035 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT3P12035 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT3P12035 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT3P12035 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT3P12035 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT3P12035 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT3P12035 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT3P12035 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT3P12035 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT3P12035 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT3P12035 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT3P12035 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT3P12035 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT3P12035 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT3P12035 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT3P12035 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT3P12035 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT3P12035 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT3P12035 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT3P12035 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT3P12035 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT3P12035 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT3P12035 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT3P12035 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT3P12035 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT3P12035 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT3P12035 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT3P12035 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT3P12035 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT3P12035 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT3P12035 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT3P12035 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT3P12035 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT3P12035 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT3P12035 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT3P12035 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT3P12035 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT3P12035 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT3P12035 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT3P12035 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT3P12035 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT3P12035 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT3P12035 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT3P12035 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT3P12035 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT3P12035 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT3P12035 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT3P12035 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT3P12035 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT3P12035 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT3P12035 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT3P12035 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT3P12035 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT3P12035 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT3P12035 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT3P12035 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT3P12035 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT3P12035 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT3P12035 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT3P12035 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT3P12035 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT3P12035 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT3P12035 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT3P12035 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT3P12035 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT3P12035 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT3P12035 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT3P12035 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT3P12035 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KRT3P12035 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KRT3P12035 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT3P12035 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT3P12035 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT3P12035 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT3P12035 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT3P12035 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT3P12035 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT3P12035 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT3P12035 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT3P12035 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT3P12035 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT3P12035 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT3P12035 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT3P12035 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT3P12035 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT3P12035 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT3P12035 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT3P12035 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT3P12035 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms