Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.72
LAMC1P11047 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC32■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
LAMC1P11047 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
LAMC1P11047 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LAMC1P11047 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LAMC1P11047 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
LAMC1P11047 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
LAMC1P11047 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LAMC1P11047 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms