Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARAP10276 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RARAP10276 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARAP10276 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARAP10276 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RARAP10276 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARAP10276 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARAP10276 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARAP10276 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARAP10276 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARAP10276 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RARAP10276 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARAP10276 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARAP10276 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARAP10276 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARAP10276 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARAP10276 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARAP10276 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARAP10276 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARAP10276 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARAP10276 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARAP10276 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARAP10276 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RARAP10276 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARAP10276 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARAP10276 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARAP10276 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARAP10276 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARAP10276 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RARAP10276 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARAP10276 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARAP10276 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARAP10276 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARAP10276 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARAP10276 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARAP10276 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RARAP10276 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RARAP10276 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARAP10276 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARAP10276 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARAP10276 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARAP10276 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RARAP10276 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARAP10276 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARAP10276 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARAP10276 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARAP10276 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARAP10276 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARAP10276 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARAP10276 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RARAP10276 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARAP10276 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARAP10276 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARAP10276 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARAP10276 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARAP10276 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARAP10276 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARAP10276 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARAP10276 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RARAP10276 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARAP10276 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARAP10276 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARAP10276 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARAP10276 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARAP10276 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARAP10276 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARAP10276 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARAP10276 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARAP10276 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARAP10276 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARAP10276 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARAP10276 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARAP10276 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARAP10276 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARAP10276 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARAP10276 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARAP10276 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARAP10276 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARAP10276 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARAP10276 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARAP10276 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARAP10276 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARAP10276 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARAP10276 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARAP10276 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARAP10276 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARAP10276 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARAP10276 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARAP10276 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARAP10276 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARAP10276 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARAP10276 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RARAP10276 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARAP10276 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARAP10276 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARAP10276 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARAP10276 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARAP10276 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARAP10276 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARAP10276 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms