Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GLI3P10071 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GLI3P10071 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI3P10071 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI3P10071 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI3P10071 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI3P10071 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI3P10071 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI3P10071 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI3P10071 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI3P10071 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI3P10071 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GLI3P10071 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GLI3P10071 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
GLI3P10071 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GLI3P10071 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GLI3P10071 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GLI3P10071 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GLI3P10071 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
GLI3P10071 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GLI3P10071 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GLI3P10071 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GLI3P10071 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
GLI3P10071 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GLI3P10071 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GLI3P10071 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GLI3P10071 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GLI3P10071 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GLI3P10071 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GLI3P10071 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GLI3P10071 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GLI3P10071 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GLI3P10071 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GLI3P10071 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GLI3P10071 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GLI3P10071 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GLI3P10071 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GLI3P10071 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GLI3P10071 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
GLI3P10071 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GLI3P10071 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GLI3P10071 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GLI3P10071 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GLI3P10071 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GLI3P10071 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GLI3P10071 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI3P10071 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI3P10071 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI3P10071 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI3P10071 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI3P10071 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI3P10071 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI3P10071 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI3P10071 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI3P10071 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI3P10071 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GLI3P10071 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GLI3P10071 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GLI3P10071 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GLI3P10071 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GLI3P10071 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
GLI3P10071 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
GLI3P10071 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GLI3P10071 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GLI3P10071 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GLI3P10071 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GLI3P10071 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
GLI3P10071 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
GLI3P10071 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GLI3P10071 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GLI3P10071 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GLI3P10071 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GLI3P10071 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
GLI3P10071 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GLI3P10071 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GLI3P10071 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GLI3P10071 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GLI3P10071 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GLI3P10071 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GLI3P10071 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GLI3P10071 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GLI3P10071 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GLI3P10071 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GLI3P10071 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GLI3P10071 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GLI3P10071 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GLI3P10071 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GLI3P10071 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GLI3P10071 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
GLI3P10071 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GLI3P10071 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GLI3P10071 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GLI3P10071 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GLI3P10071 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
GLI3P10071 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GLI3P10071 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
GLI3P10071 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
GLI3P10071 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GLI3P10071 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GLI3P10071 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms