Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
U2AF1L5P0DN76 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
U2AF1L5P0DN76 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
U2AF1L5P0DN76 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
U2AF1L5P0DN76 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
U2AF1L5P0DN76 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
U2AF1L5P0DN76 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
U2AF1L5P0DN76 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
U2AF1L5P0DN76 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
U2AF1L5P0DN76 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
U2AF1L5P0DN76 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
U2AF1L5P0DN76 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
U2AF1L5P0DN76 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
U2AF1L5P0DN76 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
U2AF1L5P0DN76 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
U2AF1L5P0DN76 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
U2AF1L5P0DN76 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
U2AF1L5P0DN76 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
U2AF1L5P0DN76 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms