Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBBP0CG47 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
UBBP0CG47 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBBP0CG47 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms