Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2MP0CAP2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
POLR2MP0CAP2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms