Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SFTA3P0C7M3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFTA3P0C7M3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTA3P0C7M3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTA3P0C7M3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms