Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRPRAP08240 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms