Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBBP07437 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBBP07437 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBBP07437 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBBP07437 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBBP07437 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBBP07437 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBBP07437 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBBP07437 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBBP07437 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBBP07437 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBBP07437 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBBP07437 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBBP07437 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBBP07437 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBBP07437 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBBP07437 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBBP07437 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBBP07437 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBBP07437 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBBP07437 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBBP07437 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBBP07437 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBBP07437 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBBP07437 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBBP07437 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBBP07437 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBBP07437 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBBP07437 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBBP07437 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBBP07437 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBBP07437 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBBP07437 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBBP07437 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBBP07437 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBBP07437 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBBP07437 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBBP07437 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBBP07437 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBBP07437 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBBP07437 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBBP07437 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBBP07437 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBBP07437 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBBP07437 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBBP07437 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBBP07437 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBBP07437 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBBP07437 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBBP07437 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBBP07437 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBBP07437 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBBP07437 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBBP07437 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBBP07437 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBBP07437 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBBP07437 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBBP07437 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBBP07437 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBBP07437 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBBP07437 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBBP07437 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBBP07437 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBBP07437 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBBP07437 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBBP07437 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBBP07437 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBBP07437 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBBP07437 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBBP07437 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBBP07437 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBBP07437 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBBP07437 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBBP07437 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBBP07437 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBBP07437 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBBP07437 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBBP07437 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBBP07437 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBBP07437 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBBP07437 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBBP07437 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBBP07437 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBBP07437 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBBP07437 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBBP07437 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBBP07437 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBBP07437 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBBP07437 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBBP07437 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBBP07437 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBBP07437 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBBP07437 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBBP07437 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBBP07437 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBBP07437 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBBP07437 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBBP07437 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBBP07437 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBBP07437 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms