Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYL1P05976 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYL1P05976 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYL1P05976 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYL1P05976 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYL1P05976 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYL1P05976 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYL1P05976 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYL1P05976 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYL1P05976 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYL1P05976 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYL1P05976 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYL1P05976 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYL1P05976 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYL1P05976 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYL1P05976 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MYL1P05976 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYL1P05976 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYL1P05976 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL1P05976 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL1P05976 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL1P05976 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL1P05976 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL1P05976 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL1P05976 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL1P05976 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL1P05976 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL1P05976 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL1P05976 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL1P05976 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL1P05976 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL1P05976 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYL1P05976 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYL1P05976 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYL1P05976 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYL1P05976 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYL1P05976 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYL1P05976 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MYL1P05976 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYL1P05976 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MYL1P05976 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYL1P05976 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYL1P05976 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYL1P05976 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYL1P05976 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MYL1P05976 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYL1P05976 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYL1P05976 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYL1P05976 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYL1P05976 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYL1P05976 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYL1P05976 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYL1P05976 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYL1P05976 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYL1P05976 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYL1P05976 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYL1P05976 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYL1P05976 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYL1P05976 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MYL1P05976 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYL1P05976 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYL1P05976 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYL1P05976 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYL1P05976 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYL1P05976 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYL1P05976 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYL1P05976 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYL1P05976 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYL1P05976 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MYL1P05976 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYL1P05976 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYL1P05976 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYL1P05976 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL1P05976 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL1P05976 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL1P05976 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL1P05976 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL1P05976 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL1P05976 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL1P05976 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL1P05976 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL1P05976 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL1P05976 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL1P05976 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL1P05976 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL1P05976 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL1P05976 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL1P05976 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYL1P05976 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYL1P05976 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYL1P05976 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYL1P05976 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYL1P05976 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYL1P05976 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYL1P05976 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYL1P05976 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYL1P05976 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYL1P05976 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYL1P05976 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYL1P05976 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms