Protein–RNA interactions for Protein: P05783

KRT18, Keratin, type I cytoskeletal 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P05783 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT18P05783 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT18P05783 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT18P05783 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT18P05783 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT18P05783 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT18P05783 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT18P05783 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT18P05783 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT18P05783 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT18P05783 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT18P05783 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT18P05783 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT18P05783 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT18P05783 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT18P05783 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT18P05783 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT18P05783 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT18P05783 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT18P05783 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT18P05783 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT18P05783 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT18P05783 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT18P05783 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT18P05783 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT18P05783 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT18P05783 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT18P05783 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT18P05783 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT18P05783 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT18P05783 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT18P05783 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT18P05783 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT18P05783 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT18P05783 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT18P05783 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT18P05783 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT18P05783 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT18P05783 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT18P05783 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT18P05783 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT18P05783 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT18P05783 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT18P05783 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT18P05783 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT18P05783 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT18P05783 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT18P05783 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT18P05783 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT18P05783 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT18P05783 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT18P05783 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT18P05783 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT18P05783 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT18P05783 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT18P05783 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT18P05783 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT18P05783 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT18P05783 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT18P05783 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT18P05783 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT18P05783 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT18P05783 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT18P05783 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT18P05783 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT18P05783 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT18P05783 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT18P05783 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT18P05783 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT18P05783 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT18P05783 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT18P05783 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT18P05783 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT18P05783 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT18P05783 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT18P05783 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT18P05783 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT18P05783 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT18P05783 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT18P05783 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT18P05783 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT18P05783 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT18P05783 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT18P05783 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT18P05783 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT18P05783 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT18P05783 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT18P05783 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT18P05783 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT18P05783 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT18P05783 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT18P05783 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT18P05783 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT18P05783 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT18P05783 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT18P05783 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT18P05783 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT18P05783 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT18P05783 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT18P05783 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms