Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDN1P05305 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDN1P05305 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EDN1P05305 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EDN1P05305 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EDN1P05305 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EDN1P05305 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EDN1P05305 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDN1P05305 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDN1P05305 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDN1P05305 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDN1P05305 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDN1P05305 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDN1P05305 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EDN1P05305 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EDN1P05305 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDN1P05305 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDN1P05305 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDN1P05305 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDN1P05305 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDN1P05305 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDN1P05305 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDN1P05305 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDN1P05305 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDN1P05305 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDN1P05305 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDN1P05305 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDN1P05305 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDN1P05305 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EDN1P05305 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDN1P05305 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDN1P05305 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDN1P05305 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDN1P05305 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDN1P05305 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDN1P05305 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDN1P05305 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDN1P05305 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDN1P05305 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDN1P05305 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDN1P05305 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDN1P05305 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDN1P05305 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDN1P05305 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDN1P05305 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDN1P05305 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDN1P05305 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDN1P05305 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDN1P05305 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDN1P05305 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDN1P05305 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDN1P05305 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EDN1P05305 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EDN1P05305 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EDN1P05305 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDN1P05305 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDN1P05305 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDN1P05305 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDN1P05305 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDN1P05305 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDN1P05305 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDN1P05305 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDN1P05305 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EDN1P05305 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EDN1P05305 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDN1P05305 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDN1P05305 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDN1P05305 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDN1P05305 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDN1P05305 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDN1P05305 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDN1P05305 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDN1P05305 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EDN1P05305 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDN1P05305 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDN1P05305 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDN1P05305 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDN1P05305 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDN1P05305 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDN1P05305 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDN1P05305 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDN1P05305 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDN1P05305 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDN1P05305 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EDN1P05305 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDN1P05305 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EDN1P05305 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDN1P05305 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDN1P05305 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDN1P05305 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDN1P05305 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EDN1P05305 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDN1P05305 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EDN1P05305 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDN1P05305 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDN1P05305 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDN1P05305 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDN1P05305 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDN1P05305 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EDN1P05305 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms