Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB4AP04350 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms