Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4FO95754 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4FO95754 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms