Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRD1O95696 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRD1O95696 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRD1O95696 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRD1O95696 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BRD1O95696 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRD1O95696 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRD1O95696 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRD1O95696 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRD1O95696 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRD1O95696 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRD1O95696 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRD1O95696 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRD1O95696 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BRD1O95696 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRD1O95696 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRD1O95696 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRD1O95696 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRD1O95696 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRD1O95696 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRD1O95696 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRD1O95696 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRD1O95696 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRD1O95696 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRD1O95696 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRD1O95696 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRD1O95696 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRD1O95696 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRD1O95696 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRD1O95696 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRD1O95696 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BRD1O95696 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRD1O95696 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRD1O95696 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BRD1O95696 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BRD1O95696 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BRD1O95696 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRD1O95696 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRD1O95696 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRD1O95696 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD1O95696 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD1O95696 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD1O95696 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD1O95696 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD1O95696 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD1O95696 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD1O95696 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD1O95696 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD1O95696 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD1O95696 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD1O95696 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD1O95696 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD1O95696 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD1O95696 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD1O95696 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD1O95696 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD1O95696 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD1O95696 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD1O95696 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD1O95696 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD1O95696 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD1O95696 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD1O95696 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRD1O95696 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD1O95696 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD1O95696 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD1O95696 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD1O95696 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD1O95696 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD1O95696 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD1O95696 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD1O95696 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD1O95696 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD1O95696 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD1O95696 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD1O95696 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD1O95696 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD1O95696 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD1O95696 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD1O95696 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD1O95696 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD1O95696 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD1O95696 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD1O95696 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD1O95696 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD1O95696 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD1O95696 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD1O95696 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD1O95696 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD1O95696 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD1O95696 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD1O95696 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD1O95696 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD1O95696 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD1O95696 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD1O95696 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD1O95696 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD1O95696 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD1O95696 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD1O95696 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms