Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF6BO95407 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms