Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UPP2O95045 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UPP2O95045 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UPP2O95045 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPP2O95045 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPP2O95045 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPP2O95045 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPP2O95045 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPP2O95045 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPP2O95045 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPP2O95045 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPP2O95045 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPP2O95045 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPP2O95045 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPP2O95045 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
UPP2O95045 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPP2O95045 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPP2O95045 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPP2O95045 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPP2O95045 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
UPP2O95045 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UPP2O95045 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPP2O95045 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPP2O95045 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPP2O95045 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPP2O95045 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPP2O95045 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPP2O95045 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPP2O95045 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPP2O95045 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPP2O95045 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPP2O95045 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP2O95045 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP2O95045 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP2O95045 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP2O95045 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP2O95045 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP2O95045 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP2O95045 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP2O95045 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP2O95045 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP2O95045 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP2O95045 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP2O95045 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP2O95045 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP2O95045 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP2O95045 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP2O95045 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPP2O95045 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPP2O95045 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UPP2O95045 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPP2O95045 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UPP2O95045 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UPP2O95045 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPP2O95045 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPP2O95045 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP2O95045 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP2O95045 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP2O95045 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP2O95045 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP2O95045 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP2O95045 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP2O95045 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP2O95045 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP2O95045 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP2O95045 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPP2O95045 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPP2O95045 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPP2O95045 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPP2O95045 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UPP2O95045 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPP2O95045 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPP2O95045 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPP2O95045 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPP2O95045 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPP2O95045 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPP2O95045 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPP2O95045 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPP2O95045 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPP2O95045 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPP2O95045 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPP2O95045 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPP2O95045 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UPP2O95045 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UPP2O95045 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPP2O95045 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPP2O95045 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPP2O95045 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPP2O95045 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPP2O95045 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPP2O95045 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPP2O95045 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPP2O95045 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPP2O95045 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPP2O95045 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPP2O95045 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UPP2O95045 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPP2O95045 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPP2O95045 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UPP2O95045 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms