Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSTN1O94985 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms