Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UFL1O94874 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UFL1O94874 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UFL1O94874 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UFL1O94874 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UFL1O94874 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UFL1O94874 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UFL1O94874 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UFL1O94874 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UFL1O94874 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UFL1O94874 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UFL1O94874 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UFL1O94874 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UFL1O94874 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UFL1O94874 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UFL1O94874 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UFL1O94874 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UFL1O94874 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UFL1O94874 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UFL1O94874 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UFL1O94874 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UFL1O94874 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UFL1O94874 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UFL1O94874 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UFL1O94874 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UFL1O94874 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UFL1O94874 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UFL1O94874 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UFL1O94874 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
UFL1O94874 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UFL1O94874 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UFL1O94874 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UFL1O94874 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UFL1O94874 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UFL1O94874 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UFL1O94874 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UFL1O94874 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UFL1O94874 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UFL1O94874 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UFL1O94874 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UFL1O94874 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UFL1O94874 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
UFL1O94874 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UFL1O94874 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
UFL1O94874 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UFL1O94874 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UFL1O94874 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UFL1O94874 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UFL1O94874 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UFL1O94874 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UFL1O94874 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UFL1O94874 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UFL1O94874 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UFL1O94874 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UFL1O94874 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UFL1O94874 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UFL1O94874 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UFL1O94874 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UFL1O94874 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UFL1O94874 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UFL1O94874 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UFL1O94874 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UFL1O94874 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UFL1O94874 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UFL1O94874 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UFL1O94874 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UFL1O94874 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UFL1O94874 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UFL1O94874 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UFL1O94874 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UFL1O94874 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UFL1O94874 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UFL1O94874 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UFL1O94874 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UFL1O94874 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UFL1O94874 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UFL1O94874 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UFL1O94874 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UFL1O94874 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UFL1O94874 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UFL1O94874 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
UFL1O94874 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
UFL1O94874 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UFL1O94874 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UFL1O94874 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UFL1O94874 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UFL1O94874 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UFL1O94874 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UFL1O94874 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UFL1O94874 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UFL1O94874 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UFL1O94874 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UFL1O94874 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UFL1O94874 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
UFL1O94874 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
UFL1O94874 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UFL1O94874 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UFL1O94874 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UFL1O94874 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UFL1O94874 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms