Protein–RNA interactions for Protein: O76011

KRT34, Keratin, type I cuticular Ha4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT34O76011 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT34O76011 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT34O76011 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT34O76011 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT34O76011 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT34O76011 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT34O76011 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT34O76011 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT34O76011 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT34O76011 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT34O76011 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT34O76011 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT34O76011 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT34O76011 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT34O76011 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT34O76011 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT34O76011 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT34O76011 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT34O76011 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT34O76011 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT34O76011 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT34O76011 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT34O76011 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT34O76011 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT34O76011 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT34O76011 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT34O76011 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT34O76011 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT34O76011 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT34O76011 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT34O76011 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT34O76011 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT34O76011 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT34O76011 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT34O76011 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT34O76011 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT34O76011 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT34O76011 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT34O76011 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT34O76011 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT34O76011 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT34O76011 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT34O76011 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT34O76011 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT34O76011 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT34O76011 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT34O76011 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT34O76011 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT34O76011 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT34O76011 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT34O76011 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT34O76011 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT34O76011 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT34O76011 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT34O76011 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT34O76011 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT34O76011 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT34O76011 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT34O76011 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT34O76011 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT34O76011 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT34O76011 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT34O76011 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT34O76011 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT34O76011 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT34O76011 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT34O76011 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT34O76011 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT34O76011 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT34O76011 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT34O76011 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT34O76011 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT34O76011 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT34O76011 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT34O76011 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT34O76011 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT34O76011 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT34O76011 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT34O76011 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT34O76011 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT34O76011 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT34O76011 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT34O76011 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT34O76011 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT34O76011 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT34O76011 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT34O76011 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT34O76011 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT34O76011 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT34O76011 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT34O76011 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT34O76011 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT34O76011 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT34O76011 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT34O76011 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT34O76011 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT34O76011 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT34O76011 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT34O76011 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT34O76011 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms