Protein–RNA interactions for Protein: O75976

CPD, Carboxypeptidase D, humanhuman

Predictions only

Length 1,380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPDO75976 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CPDO75976 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CPDO75976 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CPDO75976 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CPDO75976 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CPDO75976 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CPDO75976 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CPDO75976 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CPDO75976 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CPDO75976 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CPDO75976 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CPDO75976 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CPDO75976 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPDO75976 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPDO75976 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPDO75976 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPDO75976 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPDO75976 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPDO75976 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPDO75976 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPDO75976 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPDO75976 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CPDO75976 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPDO75976 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CPDO75976 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CPDO75976 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CPDO75976 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CPDO75976 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CPDO75976 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CPDO75976 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CPDO75976 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CPDO75976 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CPDO75976 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CPDO75976 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CPDO75976 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CPDO75976 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CPDO75976 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CPDO75976 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CPDO75976 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CPDO75976 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CPDO75976 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CPDO75976 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CPDO75976 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CPDO75976 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CPDO75976 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CPDO75976 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CPDO75976 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CPDO75976 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CPDO75976 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CPDO75976 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CPDO75976 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CPDO75976 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CPDO75976 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CPDO75976 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CPDO75976 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CPDO75976 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CPDO75976 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CPDO75976 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CPDO75976 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CPDO75976 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CPDO75976 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPDO75976 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPDO75976 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPDO75976 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPDO75976 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPDO75976 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPDO75976 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPDO75976 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPDO75976 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPDO75976 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CPDO75976 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CPDO75976 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CPDO75976 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CPDO75976 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CPDO75976 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CPDO75976 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CPDO75976 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CPDO75976 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CPDO75976 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CPDO75976 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CPDO75976 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CPDO75976 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CPDO75976 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CPDO75976 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CPDO75976 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CPDO75976 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CPDO75976 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CPDO75976 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CPDO75976 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CPDO75976 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CPDO75976 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CPDO75976 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CPDO75976 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CPDO75976 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CPDO75976 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CPDO75976 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CPDO75976 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CPDO75976 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CPDO75976 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CPDO75976 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms