Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP2O75323 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPSNAP2O75323 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms