Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMM17BO60830 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TIMM17BO60830 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms