Protein–RNA interactions for Protein: O60603

TLR2, Toll-like receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR2O60603 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TLR2O60603 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLR2O60603 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLR2O60603 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLR2O60603 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLR2O60603 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLR2O60603 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLR2O60603 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TLR2O60603 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TLR2O60603 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TLR2O60603 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TLR2O60603 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TLR2O60603 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TLR2O60603 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TLR2O60603 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TLR2O60603 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR2O60603 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR2O60603 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR2O60603 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR2O60603 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR2O60603 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR2O60603 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR2O60603 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TLR2O60603 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TLR2O60603 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TLR2O60603 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TLR2O60603 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TLR2O60603 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TLR2O60603 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLR2O60603 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLR2O60603 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLR2O60603 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLR2O60603 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLR2O60603 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLR2O60603 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLR2O60603 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLR2O60603 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR2O60603 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR2O60603 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR2O60603 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR2O60603 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR2O60603 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR2O60603 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR2O60603 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR2O60603 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR2O60603 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR2O60603 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR2O60603 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR2O60603 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR2O60603 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR2O60603 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR2O60603 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR2O60603 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLR2O60603 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLR2O60603 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLR2O60603 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLR2O60603 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLR2O60603 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLR2O60603 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLR2O60603 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLR2O60603 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLR2O60603 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TLR2O60603 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TLR2O60603 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TLR2O60603 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TLR2O60603 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TLR2O60603 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLR2O60603 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLR2O60603 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLR2O60603 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLR2O60603 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR2O60603 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR2O60603 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR2O60603 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR2O60603 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR2O60603 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR2O60603 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR2O60603 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR2O60603 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR2O60603 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR2O60603 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR2O60603 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR2O60603 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR2O60603 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TLR2O60603 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR2O60603 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR2O60603 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR2O60603 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR2O60603 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR2O60603 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR2O60603 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR2O60603 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR2O60603 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR2O60603 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR2O60603 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLR2O60603 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TLR2O60603 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TLR2O60603 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TLR2O60603 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TLR2O60603 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms