Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ATP10AO60312 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ATP10AO60312 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ATP10AO60312 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ATP10AO60312 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ATP10AO60312 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ATP10AO60312 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ATP10AO60312 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ATP10AO60312 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
ATP10AO60312 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ATP10AO60312 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms