Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DENRO43583 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DENRO43583 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DENRO43583 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DENRO43583 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DENRO43583 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DENRO43583 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DENRO43583 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DENRO43583 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DENRO43583 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DENRO43583 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DENRO43583 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DENRO43583 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DENRO43583 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DENRO43583 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DENRO43583 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DENRO43583 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DENRO43583 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DENRO43583 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DENRO43583 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DENRO43583 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DENRO43583 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DENRO43583 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DENRO43583 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DENRO43583 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DENRO43583 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DENRO43583 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DENRO43583 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DENRO43583 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DENRO43583 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DENRO43583 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DENRO43583 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DENRO43583 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DENRO43583 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DENRO43583 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DENRO43583 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DENRO43583 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DENRO43583 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DENRO43583 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DENRO43583 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DENRO43583 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DENRO43583 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DENRO43583 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DENRO43583 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DENRO43583 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DENRO43583 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DENRO43583 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DENRO43583 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DENRO43583 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DENRO43583 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DENRO43583 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DENRO43583 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DENRO43583 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DENRO43583 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DENRO43583 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DENRO43583 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DENRO43583 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DENRO43583 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DENRO43583 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DENRO43583 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DENRO43583 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DENRO43583 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DENRO43583 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DENRO43583 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DENRO43583 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DENRO43583 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DENRO43583 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DENRO43583 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DENRO43583 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DENRO43583 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DENRO43583 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DENRO43583 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DENRO43583 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DENRO43583 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DENRO43583 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
DENRO43583 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DENRO43583 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
DENRO43583 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DENRO43583 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DENRO43583 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DENRO43583 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DENRO43583 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
DENRO43583 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
DENRO43583 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DENRO43583 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DENRO43583 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DENRO43583 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DENRO43583 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DENRO43583 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DENRO43583 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DENRO43583 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DENRO43583 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DENRO43583 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DENRO43583 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DENRO43583 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DENRO43583 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DENRO43583 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DENRO43583 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DENRO43583 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DENRO43583 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms