Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SYNJ1O43426 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SYNJ1O43426 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SYNJ1O43426 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SYNJ1O43426 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SYNJ1O43426 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SYNJ1O43426 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SYNJ1O43426 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SYNJ1O43426 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SYNJ1O43426 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SYNJ1O43426 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SYNJ1O43426 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
SYNJ1O43426 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SYNJ1O43426 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SYNJ1O43426 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SYNJ1O43426 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SYNJ1O43426 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SYNJ1O43426 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC38■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SYNJ1O43426 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms